虹裏img歴史資料館

1 19/11/13(水)19:29:04 No.638383948

まずはPCのスペック挙げてもらわないことにはなんとも言えない

2 19/11/13(水)19:29:10 No.638383975

最近のネットワーク経由でソース持ってきて…みたいなツールでそれなりにでかいのビルドすれば一晩くらいとかざらにある

3 19/11/13(水)19:29:46 No.638384089

そもそもソースからビルドする必要あるのか?

4 19/11/13(水)19:31:03 No.638384385

プロでも別途ビルドサーバー建てるくらいコンパイルは時間かかる

5 19/11/13(水)19:32:59 No.638384831

>blast はホモロジー検索プログラム なんかよくわからんがホモなのはわかった

6 19/11/13(水)19:34:12 No.638385141

なんか昔emacsのビルドに5時間位かかってたこと思い出した

7 19/11/13(水)19:35:22 No.638385399

CとかC++のコンパイル時間は9割方インクルードファイルの読み込み時間な気がする

8 19/11/13(水)19:35:30 No.638385440

FreeBSDのmake worldとか１日くらいやってたなあ

9 19/11/13(水)19:35:36 No.638385463

>まずはPCのスペック挙げてもらわないことにはなんとも言えない 出先で使う為のSurface go(8GB)でWSLのubuntu動かしてる >そもそもソースからビルドする必要あるのか? GUI使えないからコンソールからコンパイルするしかない？と思って… 因みにwindows版はインストーラーでサクッとインストールできた でもlinuxのコンソールで動かせた方が何かと便利で

10 19/11/13(水)19:36:18 No.638385628

さっきもwslのスレ立ててたわけぇ？

11 19/11/13(水)19:37:13 No.638385814

基盤が何でコンパイラとコンパイルオプション何使ってるかもわからんので答えようがないがそれぐらいフツー

12 19/11/13(水)19:38:20 No.638386053

>出先で使う為のSurface go(8GB)でWSLのubuntu動かしてる WSLはファイルIOがくっそおせえので素直にクライアントHyperVでLinux建てるかWSL2使え

13 19/11/13(水)19:38:25 No.638386074

ほとんどが依存ライブラリのダウンロードとビルドだったりとかね

14 19/11/13(水)19:40:22 No.638386565

うちのマシンでlinuxカーネルビルドすると5時間くらいかかるぞ モジュールごとフルビルドすると3倍だ！

15 19/11/13(水)19:41:04 No.638386757

Surface Goでコンパイルするぐらいならデスクトップでやってからできたファイル渡すんじゃだめなの？

16 19/11/13(水)19:41:32 No.638386877

朝家出る前のやつが帰ってから終わってなかったり不通

17 19/11/13(水)19:42:51 No.638387223

とりあえず異常な状態ではないことがわかったありがとう 新しく仮想環境立てたりも検討しつつとりあえず一晩置いてみるよ…

18 19/11/13(水)19:42:57 No.638387244

>うちのマシンでlinuxカーネルビルドすると5時間くらいかかるぞ >モジュールごとフルビルドすると3倍だ！ それが嫌で差分更新のみコンパイルしてたらGCCのバグでセキュリティ脆弱性もったままだったのを10年ぐらい誰も気づかなかったCentOSとかいうやつがいるらしいな

19 19/11/13(水)19:44:50 No.638387718

どんなツールか知らんけどwin版あるならそれでいいんじゃ

20 19/11/13(水)19:50:26 No.638389168

makeしてるなら進捗表示逐一変わるだろうから止まってないなら待ってりゃいいわね

21 19/11/13(水)19:50:50 No.638389245

>どんなツールか知らんけどwin版あるならそれでいいんじゃ どうせWSLでディレクトリ共有だから気にせずwinとlinux行き来して作業してもいいかしら… 因みにblastは投げた遺伝子配列に近いやつをデータベースから探してくれるやつだよ

22 19/11/13(水)19:53:28 No.638389887

調べてみたけど素のUbuntuだとコンパイルしなくても sudo apt-get install ncbi-blast+ でインストールできるみたいよ WSLのUbuntuでも出来るかどうかは知らん

23 19/11/13(水)19:54:05 No.638390033

なにもわからない初心者だけど-jオプションつけたら急に早くなって鼻水噴いた覚えある

24 19/11/13(水)19:55:55 No.638390436

blast+はmake -jできないっぽい

25 19/11/13(水)19:56:09 No.638390492

wslはクソ遅いわ 他でビルドして持ってこれるならその方が早い

26 19/11/13(水)19:57:08 No.638390728

上で言われてるようにリポジトリにあるんじゃない？

27 19/11/13(水)19:58:05 No.638390967

WSL使うとVMWareやVBoxと共存できなくてつらい

28 19/11/13(水)19:58:16 No.638391006

どうしてもWSL側でやりたいならバイナリをaptで取ってGUIはVxXsrv使った方が良くないか それとWSLはWindows側のプログラムも呼べるぞ

29 19/11/13(水)19:59:07 No.638391203

>WSLのUbuntuでも出来るかどうかは知らん WSLはマジでLinuxのシステムコールのエミュレーションしてるだけだからよほど変なことしてなければ動くはず ただしIOはやっぱり露骨に遅いのでDBとかの検証には向いてない WSL2はコンテナで素のLinuxが動くようになったからから早い

30 19/11/13(水)20:00:11 No.638391452

>それとWSLはWindows側のプログラムも呼べるぞ そうなの！？知らんかった…コマンドプロンプトみたいに使えるってことと思っていいのかね

31 19/11/13(水)20:00:37 No.638391566

ていうかwinとの連携気にしないならvirtualboxかvmware使った方がいいんでねか

32 19/11/13(水)20:03:00 No.638392178

>調べてみたけど素のUbuntuだとコンパイルしなくても sudo apt-get install ncbi-blast+ でインストールできるみたいよ >WSLのUbuntuでも出来るかどうかは知らん うわーできた！ありがとう！一瞬で終わって笑ってしまった というか完全に検索不足だったな申し訳ない…参考にしてるサイトのやり方鵜呑みにしてしまった

33 19/11/13(水)20:03:07 No.638392214

>>それとWSLはWindows側のプログラムも呼べるぞ >そうなの！？知らんかった…コマンドプロンプトみたいに使えるってことと思っていいのかね WSLでWindows側のPowershell起動してUnixコマンドのエイリアスでコマンドレット起動するとPSなのかLinux側コマンドなのかどっちだかわかんなくなって混乱するのでお勧め

34 19/11/13(水)20:05:54 No.638392931

解決したか よかったよかった

35 19/11/13(水)20:06:26 No.638393074

>FreeBSDのmake worldとか１日くらいやってたなあ 世界作るの！？

36 19/11/13(水)20:07:33 No.638393392

実行ファイル配っても動かないの？linux

37 19/11/13(水)20:08:50 No.638393784

>世界作るの！？ そうだぞ ７日間もかからないが

38 19/11/13(水)20:10:33 [うどんわーるど] No.638394314

うどんわーるど

39 19/11/13(水)20:12:42 No.638395014

apt search パッケージ名でとりあえず探せよ

40 19/11/13(水)20:13:41 No.638395310

>apt search パッケージ名でとりあえず探せよ こんな便利なコマンドが…

41 19/11/13(水)20:13:45 No.638395333

日本語で調べるならうぶんつよりCentOSの方が情報あるんでね？

42 19/11/13(水)20:14:49 No.638395680

サーバー用途ならともかく今そんなにCentOSの情報落ちてるかな…

43 19/11/13(水)20:14:51 No.638395702

マジの初心者だった

44 19/11/13(水)20:15:31 No.638395933

CentOSはRHELを買わない客しか使わない悪い文明

45 19/11/13(水)20:17:05 No.638396467

一般用途ならUbuntuの方がよほどあると思う コロコロ変えまくるからちょっと前の情報が割と役に立たなくなるけど

46 19/11/13(水)20:17:45 No.638396675

>サーバー用途ならともかく今そんなにCentOSの情報落ちてるかな… とりあえずRHELの情報見るか… 解決案が見れない！

47 19/11/13(水)20:18:06 No.638396810

>とりあえずArch wiki見るか…